1. 研究目的与意义
内容: 缺氧诱导因子-1,即为低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)是1992年由Semenza和Wang首先发现的,随后确立了HIF-1的结构,并证明了其cDNA的编码顺序。
HIF-1普遍存在于人以及其他哺乳动物细胞内,在常氧的条件下(21%O2)也有表达现象,但合成的HIF-1蛋白很快即被细胞内氧依赖性泛素蛋白酶降解途径所降解,只有在缺氧的条件下HIF-1才可稳定表达。
HIF-1是具有转录活性的核蛋白,具有相当广泛的靶基因谱,其中包括与缺氧适应、炎症发展及肿瘤生长等相关的近100种的靶基因。
2. 文献综述
单独附在开题报告后面
3. 设计方案和技术路线
研究方案:本实验就是对已经报道的小分子抑制剂3JF进行结构的优化,提高其AlogP,同时结合3JF与pVHL的结合口袋,对其进行改造。
技术路线:首先是在苄位添加一个基团,增加其的脂水分配系数,另通过计算机模拟计算,在苄位添加基团,其AlogP能提高到2以上。
除此之外,在保留活性基团羟脯胺酸的前提下,可以对其他的氨基酸进行修饰。
4. 工作计划
2022.2~2022.3 :进行相关的文献查阅及整理工作,阅读相关资料,做好实验前期准备工作2022.3 ~2022.4 :按照既定的实验方案进行实验,记录实验过程数据2022.4 ~2022.5 :进行实验数据后处理,总结整理 ,并且完成毕业论文
5. 难点与创新点
本项目基于化合物3JF具有结构新颖,活性优良,脂水分配系数低等特点,利用计算机辅助模拟其脂水分配系数,此方法更加便捷高效,另外以蛋白-蛋白相互作用过程为切入点,立足于蛋白-蛋白相互作用动态过程中的结合特征,从而优化该化合物。
本实验采取的是传统的合成手段,在阳性对照的基础上进行结构的优化,能确保其良好的生物活性,另外可以改善其理化性质。
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