枸杞基因组DNA甲基化的MSAP分析开题报告

 2022-12-31 13:00:02

1. 研究目的与意义

一、研究内容1.枸杞基因组DNA的提取和检测:预处理、培养、提取、纯化、检测;2. MSAP体系优化及建立:酶切体系优化、基因组DNA酶切量的优化、酶切时间的优化、连接体系的优化、预扩增反应体系的优化、选择性扩增反应体系的优化、引物的筛选;3. MSAP体系的结果分析:选扩产物的聚丙烯酞氨凝胶电泳、银染、数据分析和统计4. 枸杞基因组DNA甲基化与枸杞品质(产地)的联系:随机选用宁夏、甘肃、内蒙和青海四个产地的枸杞为模型,研究不同产地的枸杞基因组DNA甲基化水平,探寻DNA甲基化与枸杞品质之间的联系。

二、研究意义枸杞为茄科(Solanacea)枸杞属(Lycium Linn)多年生灌木植物,全球该属物种有80多种。

枸杞的成熟干燥果实(中药称枸杞子)为我国的传统名贵中药材,味甘、性平,具有滋肾,润肺,补肝,明目等功效,《神农本草经》将其列为上品,是我国宝贵的药食同源型植物资源。

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2. 文献综述

植物基因组DNA甲基化的MSAP研究进展陆瑞华南京中医药大学药学院 摘 要:DNA甲基化作为一种重要的表观遗传学修饰方式,广泛存在于动物细胞和植物体中。

很多研究表明DNA甲基化不仅可以保护基因组免受外来插入序列的侵害,而且能起到调节基因表达的作用。

甲基化敏感扩增多态性法(MSAP)作为一种较新兴的DNA甲基化检测技术,近年来广泛应用于动植物基因组DNA甲基化研究中。

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3. 设计方案和技术路线

一、文献的查阅查阅与本实验相关的文献,确定课题研究方向并提出立题依据,包括研究意义和前景,国内外研究情况、水平和未来发展趋势,特色或创新之处。

二、实验计划初步规划1、枸杞基因组DNA的提取和检测取种→新洁尔灭和乙醇消毒→MS培养基培养→植物基因组DNA提取试剂盒提取→核酸浓度检测→琼脂糖凝胶电泳→DNA纯化回收试剂盒纯化回收→核酸浓度检测→获得高浓度及高纯度的枸杞基因组DNA。

2、MSAP体系优化及建立选取宁夏、甘肃、内蒙和青海四个产地的混合枸杞初步探索建立MSAP的检测体系。

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4. 工作计划

第一阶段:2022年1月~2月 文献查阅,确定研究方向,规划实验方案;第二阶段:2022年3月~4月 枸杞基因组DNA的提取和检测,确定实验方案并进行实验;MSAP体系优化及建立,初步探索实验方案及实验条件并进行实验;MSAP体系的结果分析,初步探索实验方案及实验条件;第三阶段:2022年4月~5月 MSAP体系的结果分析,确定实验方案并进行实验;提取宁夏、甘肃、内蒙和青海四个产地的枸杞的DNA进行MSAP检测,实现实验的重复性;第四阶段:2022年6月 整理实验方案和数据,总结撰写论文。

5. 难点与创新点

研究人员对枸杞的研究已有十多年时间,但研究多集中于枸杞多糖,对枸杞DNA甲基化的研究较少。

近年来研究表明DNA甲基化不仅可以植物体保护基因组免受外来插入序列的侵害,而且调节基因表达。

在过往的研究方法中,一般采用ISSR(Inter-simple sequence repeat)标记、相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)等方法来研究枸杞DNA甲基化。

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