弹尾纲鳞跳总科的系统发育研究开题报告

 2023-02-10 16:08:39

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

本课题的意义、国内外研究概况、应用前景等(列出主要参考文献)弹尾虫,又称跳虫。

体小、无翅、属于六足总纲弹尾纲。

目前,世界上已知种类多达8000余种,我国纪录种类约为400种。

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2. 研究的基本内容和问题

目标:阐明鳞跳科在弹尾纲的地位,重建其系统发生。

内容:鳞跳科的分类地位和系统发生。

利用核18S 和28S rDNA基因重建鳞跳科内部亚科和属的系统发育关系。

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3. 研究的方法与方案

研究方法:分子数据获取:总DNA 用Qiagen 试剂盒和无损non-destructiveDNA 提取法(Porco et al., 2010,有利于重检形态标本)进行提取,并利用广泛成功用于扩增跳虫的18S 和28S rDNA等引物,进行PCR 扩增以及序列测定等工作。

运用BioEdit 7.0、MEGA 5.0 等软件进行序列比对等前期数据处理,构建分子数据矩阵。

分子数据分析:碱基和蛋白质序列最佳的替代模型分别由jmodeltest 2.1.4 和prottest 3.2估算,以便后续分析。

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4. 研究创新点

数据分析方法全面、深入无论是DNA 分类、系统发育重建还是祖先性状重建,本研究都采用多角度、多理论背景的方法进行分析,全面、客观地评估物种界限、形态特征和系统发生,防止片面分析导致的假阳性结论,有利于深入了解真实的进化过程。

5. 研究计划与进展

2014年9月-2015年1月:熟悉实验操作,提取鳞跳样本DNA进行PCR扩增,得到数段目标DNA并送往测序公司测序,得到可靠的DNA序列2015年3-4月:数据分析,进行DNA分类,构建系统发育树。

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