1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
黑麦（Secale cereale L.; 2n = 14, RR）是一种异交的，具有耐旱和耐贫瘠以及其它的生物和非生物胁迫。
它是重要的作物，一般被用来做面包，酿酒和饲料。
最近它作为作物在生物量方面也被关注。
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2. 研究的基本内容和问题
1、研究目标根据荆州黑麦转录组数据设计引物，分析其扩增特点和可转移性，筛选荆州黑麦特异标记并利用辉县红-荆州黑麦异染色体系进行染色体定位。
2、研究内容2.1对前人设计和本研究合成的引物进行扩增分析，分析其扩增特点和可转移性，筛选荆州黑麦特异标记。
2.2 利用一套辉县红-荆州黑麦异染色体系，对筛选出的专化标记进行染色体定位。
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3. 研究的方法与方案
1.研究方法:DNA提取：黑麦总基因组DNA提取采用SDS法，具体步骤如下：①称取2-4 g小麦叶片，放入研钵中，加液氮后充分研磨。
②转入20 ml(约样品的一倍体积)DNA提取液中，混匀，65 ℃水浴振荡 （301-501 rpm）1 h左右。
③取出冷却至室温，加入等体积氯仿/异戊醇（24:1）混合液，充分混匀后， 室温振荡1 h左右使之完全混合。
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4. 研究创新点
筛选一批新的荆州黑麦染色体特异标记，为荆州黑麦染色体物理图谱的构建提供基础，并且还有利于新的荆州黑麦染色体结构变异体的筛选。
5. 研究计划与进展
研究计划：利用基于RNA-seq开发设计的PCR引物对普通小麦辉县红、荆州黑麦和辉县红-荆州黑麦双倍体荆辉1号进行扩增，筛选荆州黑麦染色体特异标记。
后利用一套辉县红-荆州黑麦异染色体系，对筛选出的专化标记进行染色体定位。
预期进展：筛选荆州黑麦染色体特异标记，并利用染色体结构变异体进行染色体定位。
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