1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
1.研究的目的和意义
稻田稗草是18种世界性恶性杂草之一，在水稻田危害极为严重，造成水稻的严重减产，引起巨大经济损失；二氯喹啉酸自1984年开发应用以来，由于其高效、低毒、高选择性的特点，成为稻田应用最为广泛的除稗剂之一，但随着使用年限的增加，稻田稗草对二氯喹啉酸产生了抗药性，我国已有许多稻区出现二氯喹啉酸抗药性问题的报道，也有大批研究者进行抗性机理的研究，但研究不系统，尤其是抗性的分子机理研究不深入。目前，国外研究学者已对二氯喹啉酸抗性机理问题做了一些探讨，研究了乙烯生物合成与抗药性的关系，提出了1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶与-氰丙氨酸合成酶对抗性形成可能都有影响，均可能是抗性机理的一个方面。二氯喹啉酸作为一种激素类除草剂可能会与西来稗体内的生长素受体AFB家族和生长素配体IAA/Aux结合。但二氯喹啉酸的受体仍然不明确，靶标抗性机理的研究仍无法深入进行。
本研究的目的在于：明确IAA/Aux基因是否在抗性和敏感生物型中存在结构差异和表达差异，为进一步研究该家族基因与抗性的关系打下基础。
2. 研究的基本内容和问题
1.研究的目标：通过研究二氯喹啉酸的受体，初步明确西来稗对二氯喹啉酸的抗性机理是否与受体的变化有关。
2.研究的内容：本研究以稻田西来稗为主要研究对象，以二氯喹啉酸为主要研究药剂，
选取对二氯喹啉酸敏感性水平不同的西来稗生物型，重点研究其体内乙烯生物合成及抗氧化酶活性，揭示抗性机理。
3. 研究的方法与方案
1.研究方法：定量PCR筛选可能与抗药性相关基因，通过基因克隆得到基因的全序列。
2.技术路线
①在转录组测序数据中查找拟南芥中已报道的IAA基因序列。
4. 研究创新点
根据转录组测序数据中已报道的其他生物的IAA序列同稗草的基因组比对找出同源序列，根据定量PCR找出可能与抗药性相关的序列再进行全序列的基因克隆。
5. 研究计划与进展
2018.05-2018.08学习本研究相关的基础理论知识，并查阅国内外有关参考文献，与此同时，了解、学习本实验室常用的实验手段与技术，对自己的课题有总体的认识，并初步形成课题研究的方案；
2018.08-2015.10 根据与稗草亲缘关系比较近的水稻、玉米等植物，设计引物，提取二氯喹啉酸不同施药时间处理的不同敏感性西来稗种群体内总RNA，通过反转录得到cDNA，以文献中报道的β-actin基因作为管家基因，采用定量PCR（semiquantitative reverse transcription and poly-merase chain reaction, Sq RT -PCR）技术比较抗性和敏感稗草生物型体内相关基因的表达水平。
2018.10-2019.01对表达量有差异的基因进行基因克隆，利用之前设计的引物用PCR扩增基因片段，测序后获得基因序列，然后以获得的基因序列的中间部分为模板，设计3’、5’端引物，通过3’、5’末端快速扩增（3’、5’RACE）得到相关基因的DNA的两端序列，拼接得到相关基因的全序列。
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