1. 本选题研究的目的及意义
鹅掌楸属（Liriodendron）是木兰科中唯一现存的属，包含两种落叶乔木：鹅掌楸（Liriodendronchinense）和北美鹅掌楸（Liriodendrontulipifera）。
鹅掌楸属植物因其独特的形态特征、观赏价值和木材特性而备受关注，被誉为“活化石”植物。
然而，由于生境破坏、气候变化和遗传多样性丧失等因素，鹅掌楸属植物的生存受到威胁，尤其是中国特有的鹅掌楸被列为国家二级保护植物。
2. 本选题国内外研究状况综述
近年来，随着高通量测序技术的快速发展和成本的不断降低，越来越多的研究者开始利用SNP标记进行植物遗传学研究。
SNP标记具有数量多、分布广、遗传稳定性好、易于自动化分析等优点，已广泛应用于植物遗传多样性评估、群体结构分析、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等方面。
1. 国内研究现状
3. 本选题研究的主要内容及写作提纲
本研究将以鹅掌楸为材料，利用高通量测序技术对其基因组进行部分测序，并在此基础上开发SNP标记。
1. 主要内容
1.鹅掌楸基因组DNA提取和测序：采集鹅掌楸叶片，提取基因组DNA，构建DNA文库，利用高通量测序平台进行测序。
4. 研究的方法与步骤
本研究将采用如下方法和步骤：
1.实验材料：采集鹅掌楸不同种群的叶片样品，每个种群采集10-20个个体，确保样品的代表性和广泛性。
2.基因组DNA提取：采用改良的CTAB法提取鹅掌楸叶片的基因组DNA，并利用琼脂糖凝胶电泳和NanoDrop分光光度计对DNA的完整性和浓度进行检测。
3.高通量测序：将提取的基因组DNA进行片段化处理，构建DNA文库，并利用IlluminaHiSeq平台进行高通量测序。
5. 研究的创新点
本研究将在鹅掌楸基因组SNP标记筛选方面进行探索，预期取得以下创新性成果：
1.首次利用高通量测序技术对鹅掌楸基因组进行部分测序，并开发SNP标记。
2.筛选出的SNP标记将为鹅掌楸遗传多样性评估、群体结构分析、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等研究提供重要的数据支撑。
3.本研究将为鹅掌楸的遗传资源保护和利用提供新的思路和方法。
6. 计划与进度安排
第一阶段 （2024.12~2024.1）确认选题，了解毕业论文的相关步骤。
第二阶段（2024.1~2024.2）查询阅读相关文献，列出提纲
第三阶段（2024.2~2024.3）查询资料，学习相关论文
7. 参考文献（20个中文5个英文）
1. 郭奕栋, 杨雨春, 向小娇, 等. 基于SNP的玉米抗旱性关联分析[J]. 分子植物育种, 2020, 18(21): 3307-3315.
2. 张晓玲, 郭俊杰, 段文静, 等. 基于SLAF-seq技术的辣椒抗疫病SNP标记筛选[J]. 园艺学报, 2019, 46(9): 1753-1762.
3. 陈思佳, 张哲, 刘方, 等. 基于转录组测序的烟草抗赤星病SNP标记筛选[J]. 中国烟草科学, 2021, 42(3): 60-66.
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