1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
（1）课题意义
产仔数的高低直接影响养猪生产经济效益，解析产仔数变异的遗传机理具有重要理论和应用价值。二花脸是产仔性能极其优秀的地方品种，但长期观察发现品种内产仔数分离明显。产仔数是一个复杂的性状，受到排卵率、胚胎/胎儿存活率、子宫容积等诸多因素的影响。指导教师的实验室通过全基因组扫描，发现猪13号染色体上存在显著影响二花脸猪品种内产仔数变异的基因位点，且该位点与已知子宫角长度相关的QTL#18405和#18407的位置接近。本试验拟利用PCR反应与DNA测序技术，分析该位点基因型与181头二花脸母猪窝产仔数的相关性，以验证该位点的效应。本试验将为解析产仔数变异分子机理提供部分理论依据，为选育二花脸地方品种稳定高产群体提供关键分子标记。
（2）国内外研究进展
2. 研究的基本内容和问题
（1）研究目标 ①检测该SNP位点在181头二花脸母猪内的基因型。 ②分析该SNP位点不同基因型与窝产仔数的关联性。（2）研究内容 ①采集耳组织样品、提取组织基因组DNA，检测后稀释、冷冻保存、保存备用。 ②目的片段PCR扩增与测序 ③分析结果（3）拟解决的问题 ①针对现有技术不足，产仔数的低遗传力，提供与母猪窝总产仔数相关的SNP标记。 ②运用SNP标记提高筛选窝总产仔数高的母猪。
3. 研究的方法与方案
（1）研究方法采用实验室检测与动物试验相结合的方法开展相关试验研究。
（2）技术路线 见附件（3）实验方案
①试验动物来源 江苏常州焦溪二花脸猪专业合作社。 江苏苏州常熟国家级二花脸保种场。 江苏苏州苏太企业有限公司。
4. 研究创新点
以二花脸猪为研究对象，验证GWAS获得的与窝产仔数相关SNP在181头母猪的群体内的效应，进行基因型与产仔数的关联分析，试验结果将为解析产仔数变异分子机理提供部分理论依据，为选育二花脸地方品种稳定高产群体提供关键分子标记。
5. 研究计划与进展
2015年8月--10月：采集具有准确窝产总仔数记录的181头纯种二花脸母猪的耳组织样品；2015年11月--12月：利用传统酚/氯仿法提取耳组织基因组DNA，经过质量、浓度检测后将浓度稀释到30ng/μL于-20℃下保存备用；2016年1月：用已提取的DNA为模板，根据所设计的引物，进行PCR扩增；2016年3月： PCR产物在1.2%琼脂糖凝胶中电泳检测，将剩余的扩增产物进行测序，比对、分析测序结果，判读突变的基因型，然后进行基因型对表型的影响效应分析；2016年4月： 整理数据，差缺补漏。
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